1. 基本信息

徐坤，男，遗传学博士，副教授，博导；西北农林科技大学动物科技学院羊遗传改良与生物育种创新团队、动物生化与分子生物学教研室成员。主要从事动物基因编辑技术与分子设计育种、微生物基因工程技术与合成生物学等方面的教学和科研工作。是最早从事CRISPR基因编辑技术开发的研究者之一，曾首次报道了源于嗜热链球菌的CRISPR/St3Cas9系统，并相继开发了一系列的基因编辑工具活性报告技术、供体适配基因编辑系统等哺乳动物和酵母基因编辑配套技术。累计在《Trends in Biotechnology》、《Advanced Science》、《Cellular and Molecular Life Sciences》和《遗传》、《生物工程学报》等国内外期刊发表科研论著63篇。发表论文累计被引996次、H指数16、i10指数24 (谷歌学术，截至2024.08)。个人主页：https://lab.gewu.pro/groups/index/T8B5U1

2. 招生和研究方向

招生专业和方向：动物遗传育种与繁殖、动物营养与饲料科学、畜牧，动物生物技术方向。

研究方向：动物基因编辑与分子设计育种、微生物基因工程与合成生物学；涉及动物基因编辑技术、动物（羊）分子设计育种、微生物（酵母）基因编辑技术、微生物合成生物学等课题。

3. 教学课程和奖励

承担本科生《分子生物学》、《基因编辑技术》、《细胞分子生物学实验》、《动物生物化学实验》、《科技英语写作》、《新生研讨课》和研究生《动物基因工程技术》、《动物繁殖理论与生物技术》、《基因编辑原理与技术》、《动物遗传育种进展》、《现代动物育种学》等课程教学任务。

曾获陕西首届高校课堂教学创新大赛三等奖，西北农林科技大学青年教师讲课比赛三等奖，西北农林科技大学教学成果二等奖。

4. 科研项目和成果

累计发表研究论著63篇，其中第一/通讯作者论文33篇（SCI 24篇、中文核心9篇）。申请发明专利17项，其中已授权10项。近五年来，先后承担国家农业生物育种重大专项、国家自然科学基金、陕西省重点研发计划、陕西省自然科学基金、中国博士后基金等科研项目或子任务10余项，立项经费600余万元。代表性科研项目和研究成果如下：

4.1代表性科研项目

[8] 国家农业生物育种重大专项, 2023ZD04074, 2023.11-2025.12, 在研, 任务负责人.

[7] 国家农业生物育种重大专项, 2023ZD04051, 2023.09-2025.12, 在研, 任务负责人.

[6] 陕西省重点研发计划, 2024NC-YBXM-098, 2024.01-2025.12, 在研, 主持.

[5] 深圳市自然科学基金重点项目, 基础20220161, 2023.01-2025.12, 在研, 任务负责人.

[4] 陕西省重点研发计划, 2021NY-027,  2021.01-2022.12, 结题, 主持.

[3] 中国博士后科学基金特别资助, 2018T111111,  2019.01-2020.12, 结题, 主持.

[2] 国家转基因生物新品种培育重大专项, 2018ZX0801009B, 2018.01-2020.06, 结题, 任务负责人.

[1] 国家自然科学基金青年项目, 31702099,  2018.01-2020.12, 结题, 主持.

4.2 代表性学术论著（^#同等贡献，*通讯作者）

（1）动物基因编辑技术与分子设计育种方向

[9] Lyu Ming, Sun Yongsen, Yan Nana, Chen Qiang, Wang Xin, Wei Zehui, Zhang Zhiying, Xu Kun*. Efficient CRISPR/Cas9-mediated gene editing in mammalian cells by the novel selectable traffic light reporters. Int J Biol Macromol. 2023 May; 243:124926. (2022: IF=8.1996, 学院A/中科院化学1区Top期刊)

[8] Lyu Ming, Li Fang, Wang Xu, Xu Kun*, Shuang Sun*. miR-145 Modulates Fatty Acid Metabolism by Targeting FOXO1 to Affect SERBP1 Activity in Bovine Mammary Epithelial Cells. J Agric Food Chem. 2023 May; 71(19):7440-7450. (2022: IF=6.1004, 学院A/中科院农林科学1区Top期刊)

[7] Ma Lixia, Xing Jiani, Li Qian, Zhang Zhiying*, Xu Kun*. Development of a universal antibiotic resistance screening reporter for improving efficiency of cytosine and adenine base editing. J Biol Chem. 2022 Jul; 298(7):102103.  (2021: IF=5.4853, 学校G2/中科院生物学2区Top期刊)

[6] 张潇筠, 徐坤*, 沈俊岑, 穆璐, 钱泓润, 崔婕妤, 马宝霞, 陈知龙, 张智英, 魏泽辉*. 一种新型提高HDR效率的CRISPR/Cas9-Gal4BD供体适配基因编辑系统. 遗传. 2022, 36(5): 849-60. (A类学报/学院B, 封面论文)

[5] Ren Chonghua^#, Xu Kun^#, David Jay Sega, Zhang Zhiying*. Strategies for the enrichment and selection of genetically modified cells. Trends Biotechnol. 2019 Jan; 37(1):56-71. (2018: IF= 13.7464, 中科院工程技术1区Top期刊)

[4] Li Xinyi, Bai Yichun, Cheng Xinzhen, Peter Girgis Tawfek Kalds, Sun Bing, Wu Yun, Lyu Huijiao, Xu Kun*, Zhang Zhiying*. Efficient SSA-mediated precise genome editing using CRISPR/Cas9. FEBS J. 2018 Sep; 285(18):3362-75. (2017: IF= 4.5298, 中科院生物学2区, Editor’s Choice论文)

[3] Shao Simin, Ren Chonghua, Liu Zhongtian, Bai Yichun, Chen Zhilong, Wei Zehui, Wang Xin, Zhang Zhiying*, Xu Kun*. Enhancing CRISPR/Cas9-mediated homology directed repair in mammalian cells by expressing Saccharomyces cerevisiae Rad52. Int J Biochem Cell Biol. 2017 Nov; 92:43-52. (2016: IF= 3.5049, 中科院生物学2区)

[2] Ren Chonghua^#, Xu Kun^#, Liu Zhongtian, Shen Juncen, Han Furong, Chen Zhilong, Zhang Zhiying*. Dual-reporter surrogate systems for efficient enrichment of genetically modified cells. Cell Mol Life Sci. 2015 Jul; 72(14):2763-72. (2014: IF= 5.8077, 中科院生物学2区)

[1] Xu Kun, Ren Chonghua, Liu Zhongtian, Zhang Tao, Zhang Tingting, Li Duo, Wang Ling, Yan Qiang, Guo Lijun, Shen Juncen, Zhang Zhiying*.

Efficient genome engineering in eukaryotes using Cas9 from Streptococcus thermophilus . Cell Mol Life Sci. 2015 Jan; 72(2):383-99. (2014: IF= 5.8077, 中科院生物学2区)

（2）微生物基因工程技术与合成生物学方向

[5] 刘宇飞, 曹颖, 常立业, 单聪慧, 徐坤*. 毕赤酵母细胞工厂工程化改造与应用. 生物工程学报. 生物工程学报. 2023, 39(11): 4376-4396. (A类学报/卓越期刊/学院B)

[4] Yue Feng, Du Lihong, Wang Ruyu, Han Baoquan, Zhang Xiaojun, Yao Zhangzhang, Zhang Wenqiang, Cai Chang, Zhang Zhiying*, Xu Kun*. In vivo Protein Interference Oral Administration of Recombinant Yeast-Mediated Partial Leptin Reduction for Obesity Control. Front Microbiol. 2022 Jun 14; 13:923656. (2021: IF=6.0644, 中科院生物学2区Top期刊)

[3] Hafiz Muhammad Zakria, Han Baoquan, Yue Feng, Mu Lu, Fang Yuanyuan, Li Xiaoyu, Xu Kun*, Zhang Zhiying*. Significant body mass increase by oral administration of a cascade of shIL21-MSTN yeast-based DNA vaccine in mice. Biomed Pharmacother. 2019 Oct; 118:109147. (2018: IF= 3.7426, 中科院医学2区)

[2] Han Baoquan^#, Xu Kun^#,*, Liu Zhongtian, Ge Wei, Shao Simin, Li Pengcheng, Yan Nana, Li Xinyi, Zhang Zhiying*. Oral yeast-based DNA vaccine confers effective protection from Aeromonas hydrophila infection on Carassius auratus. Fish Shellfish Immunol. 2019 Jan; 84:948-54. (2018: IF= 3.2980, 中科院农林科学类1区Top期刊)

[1] Luo Zhixin, Wang Shanhe, Jiao Beilei, Yuan Dan, Dai Dongmei, Wang Lixian, Xu Kun*, Wang Xin*.

Gene cloning and seamless site-directed mutagenesis using single strand annealing (SSA). Appl Microbiol Biotechnol. 2018 September 12; 102 (23):10119-26.  (2017: IF=3.3400, 中科院工程技术2区Top期刊)

（3）专著/丛书章节论文

[2].Zhang Zhiying, Segal David Jay, Xu Kun, eds (2020). Precise Genome Editing Techniques and Applications. Lausanne: Frontiers Media SA. doi: 10.3389/978-2-88963-779-9.

[1] Xu Kun, Liu Zhongtian, Zhang Long, Zhang Tingting, Zhang Zhiying. SiRNA In Vivo-Targeted Delivery to Murine Dendritic Cells by Oral Administration of Recombinant Yeast. In: Shum K., Rossi J. (eds) SiRNA Delivery Methods (Chapter 14). Methods in Molecular Biology (2016), vol 1364. Humana Press, New York, NY.

4.3 代表性发明专利

[8] 防治柱状黄杆菌感染的口服重组酵母菌株及其制备方法和应用. 徐坤, 姚长长, 张存芳, 刘宇飞, 敖峻珩, 贾劭娜, 宋维杰, 郝佳慧, 蔡伟杰. 申请号CN202310729111.5. 申请日2023/06/19.

[7] 红绿光切换式交通信号灯基因编辑阳性报告富集系统. 徐坤, 吕明, 张智英, 马宝霞,王旭, 孟祥宇, 李尚朴, 杨森. 申请号CN202310388217.3. 申请日2023/04/12.

[6] 一种口服酵母介导的产气荚膜梭菌α毒素重组DNA疫苗. 徐坤, 杨小军, 张文强, 杜丽宏, 姚长长, 麻啸涛, 朱宇飞, 贾邵娜, 刘宇飞, 蔡畅, 赵霞芳, 汪楚涵, 单聪慧. 申请号CN202310275151.7. 申请日2023/03/20.

[5] 一种增强基因表达的自激活Gal4/UAS系统表达盒的建立. 徐坤, 刘玉万, 张智英,娜娜, 雒志新, 韩宝泉, 李欣憶, 张哓兰. ZL 201710381327.1.

授权日期2020/5/19.

[4] 一种融合核酸外切酶的 CRISPR/Cas12i 基因编辑衍生系统及其应用. 王小龙, 魏迎辉, 徐坤, 郑文新, 吴伟伟, 陈秋崇, 姚方瑶, 罗沐华. 申请号CN202410457560.3. 申请日期2024/04/16.

[3] 基于人工核酸酶的可视化细胞修复效率报告系统及其建立方法. 张智英, 邵斯旻, 徐坤, 韩芙蓉, 沈俊岑, 白义春. ZL201611020358.6. 授权日期2020/4/21.

[2] 一种利用CRISPR/Cas9技术基于SSA修复的基因无缝编辑方法. 张智英, 白义春, 徐坤, 魏泽辉, 和林洁, 任充华, 邵斯旻, 吴芸, 刘中天. ZL201610333062.3. 授权日期2019/10/11.

[1] 基于CRISPR/Cas9的外源基因敲入整合系统及其建立方法和应用. 张智英, 吴芸, 徐坤, 白义春, 吕慧娇. ZL201610703246.4. 授权日期2019/10/8. 转让日期2021/10/29.

5．联系方式

通讯地址：陕西杨凌西农路22号西农大北校区动物科技学院

邮编：712100

Email：xukunas@nwafu.edu.cn, 564737724@qq.com

（更新时间2024.08.05）