近日,陈宏教授团队在Science China Life Sciences发表了题为“circ SVIL regulates bovine myoblast development by inhibiting STAT1 phosphorylation”的研究论文,我院博士研究生岳炳霖为该论文第一作者,陈宏教授为通讯作者。该研究发现circ SVIL 可以通过与STAT1相互作用抑制其磷酸化,进而抑制STAT1核易位来调控牛肌原代细胞的发育。
circRNA因其独特的环状结构使其较线性转录本更加稳定而被受广泛的关注,已被大量实验证实参与各种病理生理过程。目前对circRNA的研究大多数都涉及ceRNA机制,通过该方式circRNA充当“分子海绵”竞争性地结合miRNA从而间接调控miRNA靶基因的表达。然而,近期研究表明,circRNAs可能通过结合相关蛋白参与基因转录及转录后调控。
该研究从先前构建的牛骨骼肌circRNA-miRNA-mRNA三元互作网络中筛选出circ SVIL 并进行生物学功能鉴定与机制研究,通过CCK8、EdU、流式细胞术、qRT-PCR和Western blot等手段评估了circ SVIL 对牛肌原代细胞表型的影响,结果表明circ SVIL 能够促进牛肌原代细胞增殖并抑制其凋亡。根据预测的三元互作网络模型,推测circ SVIL 可能通过吸附miR-17-3p调控牛肌原代细胞发育,然而实验结果表明,尽管circ SVIL 有相当数量的miR17-3p优质结合序列,circ SVIL 却并不充当miRNA的分子海绵。由此假设可能存在某些RNA结合蛋白通过占据circ SVIL 中miR-17-3p的结合位点,甚至改变circ SVIL 的二级结构以防止其与miR-17-3p的结合。
circ SVIL 通过抑制STAT1磷酸化调控牛肌原代细胞发育的示意图
因此,该研究将重点放在寻找circ SVIL 上的蛋白结合基序,有意思的是发现circ SVIL 序列存在着转录因子STAT1的结合位点。接着,通过生物信息学预测、RNA免疫沉淀(RIP)和细胞核质分离等手段,证明circ SVIL 能够与STAT1相互作用并抑制STAT1磷酸化,从而抑制STAT1核易位并影响其下游级联信号,最终促进牛肌原代细胞增殖并抑制其凋亡。
研究结果为牛骨骼肌发育提供了新的调控途径,也为后续肉牛育种提供了潜在的候选分子,具有重要的理论和实践参考价值。
该项研究得到国家自然科学基金项目的资助。原文链接:http://apps.webofknowledge.com/full_record.do?product="UA&search_mode=GeneralSearch&qid=1&SID=8AKqre3NPy7r6AJH78Y&page=1&doc=1